从原住民的视角看，红月宇宙的历史并不算长。

6500万年前，包裹着“神印”的陨石撞击地球，导致物种大灭绝。

200万年前，某个外星种族发现了适于自己生存的海洋星球和海底的黑色神印，后因尸变体爆发，外星人濒临灭绝，但他们为了防止神印祸害其他种族，将整个星球冰冻起来，红月的聚合仪式被中断。

公元2214年，阿特曼博士发现了陨石坑里的神印，并对其进行研究，后因尸变体狂潮认为神印很危险，与试图利用神印解决能源危机的联盟政府发生冲突，被暗杀，然后被统一教当成殉道的先知。

公元2311年，联盟政府和统一教的冲突越来越大，但政府科学家还是想办法复制了几个神印，因为无法解析黑色神印的元素，复制出来的神印用其他元素代替，通体呈现红色，所以被称为红色神印。

考虑到研究的安全性和保密性，红色神印被分别安置到远离地球的殖民星球上。

神盾七号上的红色神印第一次激活，就爆发了尸变体灾难，只有红色神印周围的一小块范围可以阻止尸变体靠近（强制休眠），那片区域被称为死亡空间。

军方认为神盾七号的实验结果是失败，所有信息被封锁，红色神印和基地内的大量尸变体组合成被称为“主脑”的有机结构体。

此外，神盾七号的意外发生时，军方检测到3颗红色神印同时收到了原始神印的信号，他们顺藤摸瓜找到了冰冻星球。

公元2314年，研究人员在冰冻星球发现了外星文明和大量红色神印，他们错误地以为神印是外星人铸造的，不小心关闭冰冻装置，导致整个殖民地爆发尸变体狂潮。

察觉真相的保守派将军带头执行五号预案，清除所有跟冰冻星球有关的资料和人员，以免冰冻机器的开关落入有心人手中，再次释放红月。

此后，地球再没有收到该舰队的消息。

但将军的决断只为地球争取了200年。

之后，联盟政府洗牌（为了区分，后称联合政府），统一教势力越发壮大。

而纳米机器人首次进入的时间，便是“和谐开采公司”（简称CEC）派遣名下的行星裂解飞船“石村号”非法开采神盾七号不久。

没错，他们去挖红色神印了。