东王谕罢，又令林凤祥、李开芳、罗大纲、吴汝孝引兵东进，攻扬州击镇江，占运河之交，绝漕运之道，固天京东、南。

1853年3月28日，林凤祥、罗大纲率兵一万，乘舟东下，先克仪征，又占瓜州。31日，林、罗二分，林凤祥、李开芳北上扬州，罗大纲、吴汝孝南下镇江。

翌日，林、罗兵不血刃，进占扬州、镇江。

江苏巡抚杨文定再遁江阴，仓皇而奏：贼匪不过四五千人，并无长技。惟江南武备废弛已久，又因江宁失守，人心倍觉惊疑，遂至失事。镇江如此，其苏、常、淮、扬等府，并柔脆之兵而亦无之，又将何如。

洪杨定都金陵，二分家国，咸丰帝愤恨万分，痛下罪己诏：朕为天下之主，不能察吏安民，致贼盗肆行，阎闾警扰，生灵涂炭。朕统治抚育无方，致南北之漕运不通，淮扬之盐纲亦废，即再三引咎自责，亦是虚文。每念及此，寝不安席，食不甘味。唯修身、反省、叩吁苍天，囿朕大错，予朕改过之机，以拯黎民百姓。值此危亡之际，钦差大臣向荣、琦善、江宁将军苏步通阿等务必疾进金陵，扎营结寨，扼贼再窜；台涌、张亮基、骆秉章、江忠源、官文、曾国藩等分驻两湖，以为后应。怡良授两江总督，总理江、赣、皖地军政民务。杨文定，临阵退缩，暂行革职，留军效力。许乃钊署理江苏巡抚，即刻督兵御敌。周天爵授安徽巡抚，即日驻防庐州。

湖北按察使江忠源自金田一路战来，深知八旗、绿营“胜则争功，败则相轻”之弊习，上疏：严法令、撤提镇、汰弁兵、明赏罚、戒浪战、察地势、严约束、宽胁从。

咸丰帝嘉许，又谕令两广总督叶名琛、广东巡抚柏贵：现在贼匪东窜，江防万分吃紧，已命向荣驰赴江宁迎头截击。著叶名琛、柏贵即将该省外海水师拖古战船并快蟹、大扒等项凑足百只，多备资药，遴委水师勇干镇将大员统带，星速由海道抵江宁，听候该大臣拨用。

安徽巡抚周天爵偕安徽帮办团练大臣吕贤基疏言：事当分任，团练专令歼灭土匪；牧令守本境，统帅剿贼，不得远驻百里之外，以免推诿。眼下当今，贼逆已占金陵，须先扼黄河，杜洪杨北窜。

为事专一，周天爵辞巡抚专任兵事。吕贤基奏调给事中袁甲三、翰林编修李鸿章帮办安徽团练剿匪。

咸丰帝许，谕命周天爵以兵部侍郎衔督师剿宿州、怀远、蒙城、灵璧捻匪；刑部侍郎李嘉瑞暂署安徽巡抚，加提督衔，辖全省之军；袁甲三、李鸿章即刻赴皖，练勇御逆。