教务部下属：学园都市，海星所有高中初公立学校。

农业部下属：格林比特岛农业研究院，No.0001号卡巴内世界。

建设部下属：工程院，建工司，设计司。

宗教部下属：佛教司，基督教司。

卫生部下属：磁鼓岛医学院，所有世界医院。

【全军最高指挥院】

下属统帅部，军政部，参谋部。

统帅部下属：陆军本部，海军本部，空军本部，海忍村，辅助军团。

军政部下属：陆军军政司，海军军政司，空军军政司，战争军事学院，三军本部军校，忍界五大综合忍者高等学院，五大专科忍者高等学院。

参谋部下属：参谋一司，参谋二司，参谋三司，战功统计司。

【审判院】

下属司法岛，最高法院，司法部，警政部。

最高法院下属：法巡庭，法官庭，法才庭。

司法部下属：监狱管理署，改造司，推进城海底监狱，巴尔迪哥白土监狱，以及其他中小型监狱。

警政部下属：公安司，宪警局，赏金研究署。